Der unerwartet große Besucherandrang, die erweiterten Funktionen und das gewachsene Volumen der Sammlung machten einen Anbau an das 1992 fertiggestellte Sammlungsgebäude (Entwurf Herzog & de Meuron, Basel, Realisierung J.P. Meier-Scupin) notwendig. Um die architektonische Konzeption des Solitärbaus nicht zu stören, wurde der Anbau unterirdisch an den Bestand "angedockt" und öffnet sich nur auf der gegenüberliegenden Seite mit einem verschließbaren Schlitz dem Tageslicht. Im Anbau wurde ein kostensparendes Haustechnikkonzept mit Bauteiltemperierung und Lüftung über Erdwärmetauscher realisiert.
Der Anbau wurde ′unsichtbar′ in die ebenfalls neu gefassten Außenanlagen integriert.
2004 wurde der Raum für Medienpräsentationen umgenutzt.